Kos penggunaan Toyota Yaris Cross bergantung pada bahan api atau pengecasan, tayar, insurans dan harga varian dipilih. Petunjuk kos yang tersedia ialah RM 99,900 - 109,900. Penggunaan tenaga yang lebih rendah membantu ulang-alik, manakala harga beli yang munasabah memudahkan insurans dan pembiayaan.